بادشکن، ضدگرفتگی عضلانی، آرامبخش ملایم، ضدالتهاب، ضدعفونی‌کننده و ضدنزله است. برای درمان نفخ­های عصبی، سوءهاضمه، بیماری مسافرت، اسهال عصبی و به‌طور کلی برای اختلالات دستگاه گوارش و همچنین به‌طور موضعی برای بواسیر، آماس سینه و زخم‌های پا به‌کار می‌رود اسپاسم‌های معدی و روده‌ای و دل‌درد ، اختلالات گوارشی (زخم معده، بی‌نظمی‌های معده و سوء هاضمه‌)، اختلالات قاعدگی، آسم، تب‌، سرماخوردگی معمولی، التهاب غشاهای مخاطی ودستگاه تنفسی، سردرد، استرس و افسردگی عصبی، بی‌خوابی و اضطراب، عوارض پوستی علاوه بر بهبود اختلالات صفراوی و کمک به دفع سنگ کیسه صفرا، برای درمان بیماری‌هایی نظیر (التهابات پوستی،اگزما، کورک، زخم‌ها و امراض باکتریایی)، عفونت اندامهای تناسلی، ورم مثّانه، نیز کاربرد دارد. مور، معرق، اشتها آور، هضم کننده غذا، صفرا بر است. اثر ضد عفونی کننده ضعیف ولی قاطع دارد. مسکن درد و ضد تشنج نیز می باشد چون از ترشح و التهاب های چرکین مخاط ها جلوگیری به عمل می آورد، از این نظر به کاربردن آن در رفع یبوست هایی که مواد د فعی مخصوصا در قولون چپ جمع می شود اثر مفید دارد.
از بابونه در موارد ، آبریزش بینی ، گریپ، درمان قولنج، میگرن، و ورم پلک ها استفاده می­شود. اگر به شیر نوزادان مقدار کمی از دم کرده کاپیتول های گیاه افزوده شود، دل پیچه ناشی از نفخ و حالات تشنجی کودک رفع می شود. در استعمال خارجی ضماد، لوسیون و حمام فرآورده های این گیاه اثر قاطع در رفع بیماری ها دارد
به طوری که از آن برای محفوظ نگهداشتن زخم از آلودگی ها و بهبو زخم های عمیق، زخم انگشتان، رفع التهاب و درمان ورم چشم و مخاط دهان ، حلق ولثه ها می توان استفاده به عمل آورد . همچنین خستگی چشم را تسکین می دهد .

استفاده از بابونه عموماً بی خطر است. لیکن چای غلیظ این گیاه می تواند سبب استفراغ گردد. اگر به "ابروسیا" حساسیت دارید باید از مصرف بابونه بپرهیزید چون این دو از یک تیره گیاهی هستند. از مصرف زیاد آن در دوران بارداری یا شیردهی اجتناب ورزید. اگر باردار هستید موضوع مصرف آن را با پزشک معالج خود در میان بگذارید.

برای تهیه چای بابونه گلهای آنرا در داخل کیسه های چای بسته بندی می کنند، یا آنها را کوبیده و بخار می دهند که محتوای روغن آن که آبی رنگ است به طور جداگانه قابل استخراج و بسته بندی باشد. روغن بابونه حاوی ترکیباتی است که از ورم اعضای بدن جلوگیری می کند و در کاهش روند رشد باکتریها، ویروسها و حتی قارچها مؤثر است.
برای استفاده از بابونه، به عنوان داروی شستشو از محلول 3 تا 10 درصد آن استفاده کنید (گیاه مزبور در آب جوشانیده باشد که به این حالت چای بابونه نیز گفته میشود). برای درمان پسوریازیس، اگزما یا پوست خشک و فلسی، از کرم بابونه حاوی 3 تا 10 درصد محتوای داروی خالص بابونه استفاده کنید.

کومارین، فلاوونوئید، اسانس، آمینواسید، مواد تلخ، پلی‌ساکارید، اسیدهای چرب، تانن، هیدروکربن‌های تری‌ترپنی.